轄區鄉鎮為：吉里于孜鎮、墩麻扎鎮、英塔木鎮、胡地亞于孜鎮、巴依托海鎮、阿熱吾斯塘鎮、喀什鎮、薩木于孜鎮、溫亞爾鎮、維吾爾玉其溫鎮、吐魯番于孜鄉、薩地克于孜鄉、武功鄉、曲魯海鄉、愉群翁回族鄉、麻扎鄉、喀拉亞尕奇鄉、阿烏利亞鄉。

伊寧縣自古以來多民族聚居，境內共有32個民族，主要有漢、維吾爾、哈薩克、回、東鄉、撒拉等民族。